ШОС уделяет большое внимание развитию сотрудничества в области охраны окружающей среды. На постоянной основе функционируют такие рабочие механизмы, как Совещание руководителей министерств и ведомств государств – членов ШОС, отвечающих за вопросы охраны окружающей среды, а также подотчетная данному Совещанию экспертная рабочая группа.
К настоящему моменту проведено 6 Совещаний, последнее состоялось под председательством Китайской Народной Республики 3 июля 2025 года в гибридном формате в городе Тяньцзинь. Основное внимание было уделено вопросам устойчивого низкоэмиссионного развития, охране биологического разнообразия, управлению отходами, предупреждению и устранению опустынивания и деградации земель. Седьмое Совещание пройдет в апреле 2026 года в Бишкеке под председательством Кыргызской Республики.
В рамках ШОС активно продвигается климатическая повестка. Первым документом в данной сфере стало Заявление Совета глав государств о реагировании на изменение климата, принятое на Самаркандском саммите ШОС в 2022 году. В 2024 году было принято решение о создании Специальной рабочей группы по вопросам изменения климата, проект Положения которой обсуждается на экспертном уровне. Кроме того, в настоящее время эксперты рассматривают проект Соглашения о сотрудничестве в борьбе с изменением климата между правительствами государств – членов Шанхайской организации сотрудничества.
Развивается взаимодействие с международными организациями. Так, 28 февраля 2024 года на полях ЮНЕА-6 подписан Меморандум между Секретариатом ШОС и Программой ООН по окружающей среде (ЮНЕП), а также проведено совместное специальное мероприятие высокого уровня ШОС-ЮНЕП "Одна планета, одно будущее: объединяя усилия для экологической устойчивости".