С 2012 года действует механизм Совещания руководителей министерств и ведомств науки и техники государств-членов ШОС (далее – СМНТ). При СМНТ функционирует Постоянно действующая рабочая группа по научно-техническому сотрудничеству государств-членов ШОС.
В соответствии с Соглашением между правительствами государств-членов ШОС о научно-техническом сотрудничестве (13 сентября 2013 года, г.Бишкек) основными направлениями взаимодействия СМНТ являются охрана окружающей среды и рациональное использование природных ресурсов; наука о жизни; сельскохозяйственные науки; наносистемы и материалы; информационные и телекоммуникационные технологии; энергетика и энергосбережение; наука о Земле, в том числе сейсмология и геология; другие взаимосогласованные области сотрудничества.
С 2012 по 2025 годы проведено 9 заседаний СМНТ.
12 июня 2025 года в г.Чэнду под председательством Китайской Народной Республики состоялось 9-е заседание СМНТ. Подписан итоговый протокол, утверждена Дорожная карта по реализации Программы сотрудничества государств-членов ШОС по развитию искусственного интеллекта.
Председательство в СМНТ в 2025-2026 годах перешло Кыргызской Республике.