С 2012 года действует механизм Совещания руководителей министерств и ведомств науки и техники государств-членов ШОС (далее – СМНТ). При СМНТ функционирует Постоянно действующая рабочая группа по научно-техническому сотрудничеству государств-членов ШОС.
В соответствии с Соглашением между правительствами государств-членов ШОС о научно-техническом сотрудничестве (13 сентября 2013 года, г.Бишкек) основными направлениями взаимодействия СМНТ являются охрана окружающей среды и рациональное использование природных ресурсов; наука о жизни; сельскохозяйственные науки; наносистемы и материалы; информационные и телекоммуникационные технологии; энергетика и энергосбережение; наука о Земле, в том числе сейсмология и геология; другие взаимосогласованные области сотрудничества.
С 2012 по 2026 годы проведено 10 заседаний СМНТ.
22 мая 2026 года в г.Бишкеке под председательством кыргызской стороны состоялось 10-е заседание СМНТ. Подписан итоговый протокол. Принята Программа сотрудничества государств-членов ШОС по формированию "Зеленого технологического коридора" на 2026–2030 гг.
Председательство в СМНТ в 2026-2027 годах перешло Исламской Республике Пакистан.