21 ноября 2016 года Генеральная Ассамблея ООН без голосования путем аккламации приняла резолюцию «Сотрудничество между ООН и ШОС», призванную способствовать поступательному развитию и дальнейшему наращиванию взаимодействия между универсальной глобальной и региональной организациями.
Резолюция по-новому раскрывает широкий спектр практической деятельности ШОС. В частности, в документ включены ссылки на целый ряд важных шосовских документов по развитию сотрудничества в различных областях, принятых за последние годы. Особо отмечен главный итоговый документ саммита ШОС в Ташкенте 2016 года — Декларация 15-летия ШОС.
Работа по согласованию и продвижению проекта документа в рамках Генеральной Ассамблеи велась постоянными представителями шести государств-членов ШОС при ООН. Ее координацию осуществляло Постоянное представительство председательствующей в 2016-2017 гг. в ШОС Республики Казахстан во главе с Чрезвычайным и Полномочным Послом К.К.Абдрахмановым.
Резолюцию Генассамблеи ООН представил заместитель министра иностранных дел Республики Казахстан А.Камалдинов.
К Генеральной Ассамблее ООН обратился Генеральный секретарь ШОС Р.Алимов. Он поблагодарил членов сообщества наций и выразил уверенность, что новый документ станет прочной основой для дальнейшего наращивания взаимодействия между ООН и ШОС.
В Резолюции обозначены признание и поддержка международным сообществом деятельности и возрастающего вклада ШОС в качестве важнейшей региональной организации для рассмотрения вопросов безопасности в регионе во всех аспектах. Особо отмечаются усилия государств-членов ШОС, направленные на преобразование региона в пространство прочного мира, дружбы, процветания и согласия, а также роль объединения в деле обеспечения мира и устойчивого развития, содействия развитию регионального сотрудничества, укрепления добрососедских отношений и взаимного доверия.
Генеральная Ассамблея ООН дала высокую оценку работе ШОС в рамках реализации таких крупных и актуальных задач мирового значения, как построение мира, свободного от ядерного оружия, борьба с терроризмом, сепаратизмом и экстремизмом, транснациональной организованной преступностью, предупреждение конфликтов, укрепление международной информационной безопасности и др.
Особо подчеркнуты достижения ШОС в совместной борьбе с наркоугрозой. В этой связи отмечены Антинаркотическая стратегия ШОС на 2011-2016 гг. и План действий по ее выполнению, а также практическая значимость Меморандума о взаимопонимании между Секретариатом ШОС и Управлением ООН по наркотикам и преступности от 2011 года.
В резолюции также отмечается вклад ШОС в развитие регионального экономического сотрудничества по таким направлениям, как торговля, энергетика, транспорт, сельское хозяйство, агропромышленный комплекс, банковское дело и финансы, телекоммуникации, наука и технологии, таможенное регулирование, регулирование миграции, образование, здравоохранение, охрана окружающей среды, уменьшение опасности стихийных бедствий и др.
Генеральная Ассамблея ООН приветствует запуск процесса приема в ШОС Индии и Пакистана, что рассматривается в качестве важного практического шага по дальнейшему повышению потенциала ШОС и ее роли в международных делах.
Отмечаются также усилия ШОС по развитию сотрудничества с другими региональными организациями, включая ОДКБ, СНГ, АСЕАН, СВМДА и ОЭС.
Принятый документ предоставляет дополнительные возможности для дальнейшего развития и расширения взаимозаинтересованного диалога и взаимодействия ШОС с постоянно действующими структурами и институтами ООН. Так, Генассамблея подчеркивает важность укрепления диалога, сотрудничества и координации между системой ООН и ШОС и предлагает Генеральному секретарю ООН и специализированным институтам, организациям и фондам Всемирной Организации продолжить линию на развитие взаимодействия с ШОС в интересах совместного осуществления программ, направленных на достижение общих целей.
В практическом плане взаимодействие двух организаций предусматривает поддержание регулярных контактов по целому ряду направлений деятельности, обмен информацией и совместную экспертную работу, проведение совместных мероприятий.
 
ШОС имеет статус наблюдателя при Генеральной Ассамблее ООН с 2004 года.
5 апреля 2010 года в Ташкенте была подписана Совместная декларация о сотрудничестве между Секретариатами Шанхайской организации сотрудничества и Организацией Объединенных Наций.
14 июня 2011 года в Астане был подписан Меморандум о взаимопонимании между Секретариатом Шанхайской организации сотрудничества и Управлением ООН по наркотикам и преступности.
Меморандум о взаимопонимании между Секретариатом Шанхайской организации сотрудничества и Секретариатом Экономическая и социальная комиссия для Азии и Тихого океана ООН был подписан 15 декабря 2015 года (г.Чженчжоу).