26-28 апреля 2016 года в Москве под председательством российской стороны прошло заседание Специальной рабочей группы по таможенному сотрудничеству государств-членов ШОС.
Повестка дня заседания включила актуальные вопросы по дальнейшей реализации Программы взаимодействия таможенных служб государств-членов ШОС на 2016-2021 года. Экспертами обсуждены возможности применения системы управления рисками и взаимодействие в правоохранительной сфере, рассмотрены проекты протокола об обмене информацией, необходимой для определения и контроля таможенной стоимости товаров, а также меморандума о взаимной интеграции национальных транзитных систем.
Согласованы предложения к проекту Перечня по дальнейшему развитию проектной деятельности в рамках ШОС на период 2017-2021 годы, утверждение которого планируется в ходе заседания Совета глав правительств (премьер-министров) государств-членов ШОС во второй половине 2016 года в Кыргызской Республике.
 
Специальная рабочая группа по таможенному сотрудничеству осуществляет свою деятельность при Совещании министров государств-членов ШОС, отвечающих за внешнеэкономическую и внешнеторговую деятельность с целью реализации положений Программы многостороннего торгово-экономического сотрудничества государств-членов ШОС. При Совещании министров также осуществляют работу специальные рабочие группы по развитию транзитного потенциала, по содействию инвестициям, по электронной торговле по современным информационным и телекоммуникационным технологиям и по упрощению торговли.