В декабре 2016 года был дан старт новому международному культурно-спортивному проекту — Марафону ШОС.

Марафон ШОС стал практическим олицетворением синергии спортивного и шанхайского духа, триумфом силы человеческого духа, утверждением здорового образа жизни, внес важный вклад в укрепление дружбы и сотрудничества между людьми и народами, в развитие культурно-гуманитарного сотрудничества на пространстве ШОС.

17 декабря 2016 года в административном центре провинции Юньнань — городе Куньмине состоялся первый Марафон, в котором приняли участие 15 600 спортсменов, участниками забегов на различные дистанции стали представители из 18 стран «семьи ШОС», а также Германии, Кении, США, Эфиопии, Канады, Франции, Сенегала и Уганды.

Все дистанции Марафона проходили по живописным историческим частям города, вдоль озера Дяньчи, которое по своим размерам находится на 6-м месте среди самых больших озер Китая.

31 декабря 2017 года в Куньмине состоялся второй Международный Марафон ШОС в нем приняли участие 14 300 спортсменов из 27 стран мира. В рамках Марафона была организованна масштабная культурная программа: красочные выступления национальных коллективов и презентации традиционных обычаев народностей провинции Юньнань.

2 декабря 2018 года в Куньмине состоялся третий Международный Марафон ШОС. Он вызвал большой интерес и стал самым представительным и масштабным спортивным состязанием в истории Организации.

Для оценки уровня организации соревнований, трассы и условий проведения Марафона ШОС в Куньмин прибыл инспектор Международной ассоциации легкоатлетических федераций (IAAF) господин Норри Вильямсон. В течение двух дней специалист изучал условия организации и проведения мероприятия, а во время самого забега находился в специальной мониторинговой машине, следовавшей впереди бегущих спортсменов на протяжении всей дистанции.

Участниками Марафона ШОС стали также послы стран «семьи ШОС» и национальные координаторы государств-членов, которые провели плановое заседание своего Совета (СНК) в Куньмине накануне Марафона.

Более 20 тысяч атлетов, среди которых порядка 12 тысяч — мужчины и 8 тысяч женщин, соревновались в забеге по четырем дистанциям: марафон (42,145 км), полумарафон, 7-километровый «Здоровый забег» и «Семейный забег» длиной 2,6 км. Среди участников были не только новички, но и ветераны, представители разных возрастов и профессий. Отдельной категорией участников стали люди с ограниченными возможностями.

Заявки на участие в состязаниях подали 41626 человек. На старт, по результатам жесткого отбора, вышли 20002 атлета из 52 стран мира, в том числе «стран семьи» ШОС, Германии, Канады, Кении, США, Таиланда, ЮАР и других. В организации Марафона ШОС было задействовано свыше 280 тыс. человек, среди которых около 4 тыс. волонтеров, а также судьи, медицинский персонал, сотрудники полиции.

25 июня 2019 года Куньмине состоялась презентация четвертого масштабного события в деятельности Организации — Международного Марафона ШОС-2019.