В соответствии с решениями Совета глав государств и Совета глав правительств (премьер-министров) государств-членов ШОС созданы следующие совещания руководителей отраслевых министерств и/или ведомств:
- Совещание министров, отвечающих за внешнеэкономическую и внешнеторговую деятельность;
- Совещание министров транспорта;
- Совещание министров сельского хозяйства;
- Совещание министров энергетики;
- Совещание министров промышленности ;
- Совещание руководителей министерств и ведомств, осуществляющих взаимодействие в сфере карантина растений;
- Встреча министров финансов и председателей центральных (национальных) банков;
- Встреча руководителей высших органов аудита (финансового контроля);
- Встреча руководителей железнодорожных администраций (железных дорог).
В ведении указанных механизмов сотрудничества находятся такие рабочие группы, как Комиссия старших должностных лиц министерств и ведомств, отвечающих за внешнеэкономическую и внешнеторговую деятельность, Специальная рабочая группа по содействию инвестициям, Специальная рабочая группа по развитию транзитного потенциала, Специальная рабочая группа по электронной торговле, Специальная рабочая группа по упрощению торговли, Специальная рабочая группа по таможенному сотрудничеству, Постоянно действующая экспертная рабочая группа по вопросам сельского хозяйства, Совместная комиссия по созданию благоприятных условий для международных автомобильных перевозок, Рабочая группа при Встрече руководителей железнодорожных администраций, Специальная рабочая группа по развитию сотрудничества в сфере транспорта, Экспертная группа по реализации Дорожной карты государств-членов ШОС по постепенному увеличению доли национальных валют во взаимных расчетах.
Координация сотрудничества и содействие взаимодействия государств-членов ШОС по вышеуказанным направлениям осуществляется Департаментом по экономическим вопросам Секретариата ШОС.